开发区管委会是吉林市人民政府的派出机构，代表市政府对开发区的开发建设实施统一领导和管理。其主要职责是：依据国家法律、法规，编制开发区总体规划和经济、社会发展计划并组织实施；按国家和省、市规定的权限，报批或审批在开发区内的投资项目；负责开发区内财政、国有资产、税收、工商、土地、房屋产权产籍、环境保护以及社会治安等工作。开发区管委会不承担区域内社会事务管理职能。 开发区管委会内设4个机构，具体职责如下：
   （一）党政工作办公室
    党政工作办公室是负责党务、行政事务、综合协调、政策研究等项工作的职能部门。主要职能是：负责开发区党的建设、精神文明建设、思想政治宣传和纪检监察、群团工作；负责开发区中层干部考核管理，后备干部培养考核管理工作；负责派驻开发区办事机构的领导班子考核工作；负责开发区经济发展软环境建设工作；负责开发区重要文件、重要会议材料的起草和文字综合工作；负责开发区政策、信息收集整理上报工作；负责有关开发区发展政策的调查研究，为领导提供决策参考；负责开发区文秘档案、机要保密工作；负责外事接待、会议组织、行政事务、安全保卫、后勤管理工作；负责开发区对外法律事务及有关合同的审定；负责开发区相关政策、法规业务的咨询服务工作；负责督查督办工作；受理来信来访；负责开发区机关及事业单位机构编制、人事调配、职称评审考核、培训开发、工资审批、出国人员政审、人事档案管理、开发区人才库建设及为区内企业提供人才交流服务、档案托管等工作；负责开发区信息网络建设和管理工作。
   （二）财政局
    财政局是负责财政、审计和国有资产管理等工作的职能部门。主要职能是：负责拟定和组织实施开发区财政发展战略和规划；负责编制开发区预算、决算，并组织预算执行；负责组织开发区各项财政收入；负责监督国家财政、税务有关法律、法规的实施；负责开发区投融资及资本运作工作；负责协调财税业务工作；管理会计事务、国家专控商品、基建投资及开发区预算单位财务、审计事务；管理国有资产。
   （三）经济发展局（加挂体育旅游局牌子）
    经济发展局是负责招商引资、项目开发、经济贸易管理、体育旅游等工作的职能部门。主要职能是：负责制定开发区招商引资政策规定，开发区产业项目；负责积累、汇总、包装、培育对外招商项目，编制项目简介；负责争取和利用国内外资金、技术和管理经验，发布对外招商项目；负责组织对外招商活动，广泛开展经济贸易合作；审批或报批“三资”企业和外资项目；协助区内企业办理进出口经营配额许可证，办理劳务输出的审批手续；负责编制开发区经济和社会发展战略、中长期规划和年度计划并组织实施；负责区内计划统计工作；负责体育旅游产业发展规划制定、实施和市场预测、开发工作。
   （四）土地规划建设局
    土地规划建设局是负责土地规划、建设、环保、城管等项工作的职能部门。主要职能是：负责国家、省、市土地、规划、建设、环保、城管法律法规政策的宣传落实；负责制定区域内土地管理、规划建设、环保城管的相关规定；负责修订和完善开发区土地利用总体规划并组织实施；负责开发区内矿产资源的管理工作；负责建设项目征占地管理及土地监察工作；负责开发区总体发展规划的编制，详细规划的设计并组织实施；负责区域内建设项目的规划选址、规划设计、规划审批、规划监察等管理工作；负责审批建筑工程、市政建设工程、公用设施建设项目；负责规划并组织实施基础设施建设项目；管理开发区房地产开发、房屋产权产籍；负责制定开发区环境保护规划并组织实施；负责区内企业环保审批管理工作；负责区内企业环保排污费的收缴工作。